Unter vielen weiteren Ansätzen wurden post mortem Gewebeproben von Patienten mit spät einsetzender Alzheimer-Demenz (AD) und gesunden Kontrollen vier AD-sensible Regionen untersucht: superiorer temporaler Gyrus (STG, n = 137), anteriorer präfrontaler Kortex (APFC, n = 213), inferior frontaler Gyrus (IFG; n = 186) und parahippokampaler Gyrus (PHG, n = 107).
In einer Integration der histopathologischen Befunde (Amyloid-Plaques, Fibrillen) mit Daten zu Virom, Genom (mittels „Whole-exome“ DNA und RNA-Sequencing), Transkriptom (in Regionen, die am frühesten einen AD-bedingten Neuronenverlust aufweisen wie entorhinaler Kortex und Hippokampus) und Proteom sowie den verfügbaren Kognitionsbefunden wurden „Probabilistic causal networks“ (PCN) für eine präklinische AD konstruiert.
Die Berechnungen ergaben, dass mehrere Viren einen Einfluss hatten. Am stärksten fielen die Befunde zu Lasten des neurotropen humanen Herpesvirus 6A (HHV-6A), 6B (HHV- 6B) und 7 (HHV-7) aus. Im Vergleich mit den Kontrollen wurden bei den AD-Patienten etwa doppelt so viel HHV-6A und HHV-7 festgestellt; besonders konsistent waren die Befunde in den AD-Proben in APFC und STG.
Besonders HHV-6A wirkte sich auf vielen Ebenen prominent aus: Seine RNA- bzw. DNA-Menge und -Verteilung sowie die „Viral quantitative trait loci“ (vQTL)-Marker zeigten Assoziationen mit AD-Merkmalen, es fand sich eine vermehrte Expression von AD-Risiko-Genloci und eines bedeutenden Teils der AD-Risiko-Gene.
In der Tat wirkte sich HHV-6A am umfassendsten aus und beeinflusste die Gene/Genprodukte, die den APP-Stoffwechsel regulieren in allen Geweben. Bspw. ergab sich durch HHV-6A eine Induktion von Amyloid beta precursor protein binding family B member 2 (APBB2), Bridging Integrator 1 (BIN1), b-site amyloid precursor protein cleaving enzyme 1 (BACE1), Clusterin (CLU), Phosphatidylinositol Binding Clathrin Assembly Protein (PICALM) und Gamma-secretase subunit presenilin-1 (PSEN1). JL